חכם יצחק חזקיה למפרונטי נולד לאמו ולאביו חכם שמואל, בכ"א בשבט תל"ט (1679), בעיר פרארה שבאיטליה, אליה הגיעה משפחתו מתורכיה, בראשית המאה.
בשנת תמ"ח (1685), בהיותו בן שש, מת עליו אביו, ואמו מסרה אותו ללמוד בבית מדרשם של החכמים חכם שבתי ריקנאטי וחכם שבתי סנגויניטי, וחכם מנוח פרווינצאל בעיר לוגו. לאחר מכן נסע חכם יצחק למפרונטי הצעיר לעיר פאדובה על מנת ללמוד רפואה, ובזמן שהותו שם למד במקביל גם בישיבת פאדובה שבראשה עמד החכם הרופא רבי יצחק חיים כהן מהחזנים. לאחר סיום לימודיו נסע למנטובה ולמד אצל ראש רבני איטליה, חכם יהודה בריאל.
בשנת ת"ע (1710) הוסמך לרבנות ובשנת תק"ג (1743) נבחר לכהן כראש ישיבת פרארה.
חיבורו הידוע ביותר של חכם יצחק למפרונטי הוא האנציקלופדיה ההלכתית 'פחד יצחק' - אוסף עצום בן ארבעה כרכים המכיל כמעט את כל המושגים והמונחים מספרות התלמוד, המדרש והספרות הרבנית, על-פי סדר האלף-בית. הכרך הראשון נדפס בוונציה בשנת תק"י (1750). בשנת תקי"ג (1753) נדפס הכרך השני. שאר החלקים נדפסו לאחר מותו על ידי בנו שלמה. במאה ה-19 פורסמה האנציקלופדיה כולה ע"י 'חברת מקיצי נרדמים' בעיר ליק שבגרמניה.
חכם יצחק למפרונטי שימש כרופא, ובמקביל עסק בחינוך. הוא הקים בית מדרש למבוגרים, שלמדו תורה לאחר שעות העבודה. תחת ניהולו, הוציאה ישיבת פרארה כתב עת פנימי בשם 'ביכורי קציר', שהכיל מחקרים הלכתיים של תלמידיו.
חכם יצחק למפרונטי נפטר ביום י"ב בכסלו תקי"ז (1756).
מקום קבורתו אינו ידוע, מכיוון שזמן קצר לפני מותו הוציאה האינקוויזיציה צו שאסר לסמן קברי יהודים במצבות. עם זאת, בשנת תרל"ב ( (1872הניחה עיריית פרארה לוח זיכרון לכבודו על הבית שבו חי ופעל.