חכם דניאל הכהן נהר נולד לאמו מרים ולאביו יהושע אברהם בשנת תקס"ד (1804) באיזמיר שבתורכיה.
הוא למד תורה מפי החכם רחמים אריה ארייאש, שלימים הפך להיות חמיו, ומפי החכם המכונה הפרד"ס חכם רפאל פנחס די שיגורה.
לאחר שקידתו בתורה, יצא בגיל עשרים וחמש לעסוק במסחר, ובשל מחלת אביו היה מפרנס גם את הוריו. בעסקיו עשה חיל ובד בבד תמך בקרוביו ועזר להם בנישואי הבנות מכיסו הפרטי. על אף עיסוקו במסחר לא פסק מלימודיו בתורה, הפריש מממונו לכתוב לו ספר תורה, ועזר בהדפסת כמה ספרי קודש שהיו בכתבי יד.
כל ימיו איוותה נפשו לעלות לארץ ישראל, וכשהגיע לגיל שבעים הגשים חלום זה. הוא עלה ונתיישב בעיר הקודש צפת, שם כיהן כרב וכדרשן. מסיבה שאינה ידועה, לאחר ארבע שנים בארץ ישראל חזר לאיזמיר.
חכם דניאל הכהן נהר נפטר ביום כ"ז אייר תרמ"א (1881) באיזמיר ביותו בן 77. ביום פטירתו אסף את משפחתו ובירך אותם בצלילות הדעת, וכשסיים החיל להתפלל את תפילת 'עלינו לשבח' עד שפסק, ונפטר.
חכם דניאל הכהן נהר כתב כמה חיבורים אך הם נשרפו ב'שריפה הגדולה' שהייתה בתורכיה בשנת תר"א (1841). ספרו הנותר לפליטה 'יד הנהר' נדפס לאחר פטירתו בהשתדלות בנו, בדפוס אברהם פונטרימולי, איזמיר שנת תרמ"ד (1884). בספר 14 דרשות שדרש בזמנים שונים. בפתח הספר נדפסה צוואתו, שנמצאה בין תכריכיו אשר הכינם עוד בחייו, והיא מלאה בדברי מוסר ויראת שמיים.
"Who is she that shines through like the dawn, Beautiful as the moon, Radiant as the sun Awesome as bannered hosts?" According to what is written in the holy Zohar, there is more to know about the mystery and order of the Redemption. In the Redemption of the future, light will not immediately shine everywhere out of the darkness. This is similar to the case of a person sitting in the darkness who would lose their sight and be blinded by looking at the sun. The thin light of dawn will be first, followed by light similar to that of the moon - which is slightly brighter than the light of dawn, followed by light such as that of the sun, which is brighter than the moon. This is what is meant by "Who is she that shines through like the dawn, Beautiful as the moon, Radiant as the sun". Then will He raise us and our banner – "Awesome as bannered hosts". This is indicated in the verse "a table for me in full view of my enemies" – that the light of our Redemption will grow and rise up high, as indicated by the word shulchan (table) the (Hebrew) initials of dawn, moon, sun, banners.
Yad Nahar, Sermon 9 – A Eulogy, p. 80a, Abraham Pontrimoli Press, Izmir, 1884