חכם ד"ר הלל פרחי נולד לאמו רנה ולאביו יעקב מאיר בשנת תרכ"ח (1868) בדמשק שבסוריה.
גדל בתורה וביראה על ברכי חכמי דמשק למד בתלמוד תורה ובישיבה, והשלים השכלתו בבית הספר הכללי. למד שפות, מלבד עברית שלט בשפות הערבית, תורכית, צרפתית, אנגלית ואיטלקית.
בשנת תרמ"ו (1886) מונה לתפקיד המזכיר הכללי של המחוז העות'מאני 'רשאיא אל-ואדי', מזרח לבנון של ימינו, ושימש בתפקיד במשך שלוש שנים. נשא לאישה את מרת אסתר לבית סיטון, ונולדו להם שני בנים וארבע בנות.
בשנת תרמ"ט (1889) עבר לעיר ביירות שבלבנון, שם למד רפואה באוניברסיטה האמריקאית. בתום לימודיו עבר ללונדון, והתמחה ברפואה במשך ארבע שנים. בלונדון לקה במחלת השחפת, ובהמלצת רופאיו עבר לחלואן שבמצרים. בשנת תר"ס (1904), לאחר שנרפא ממחלתו, שימש רופא חברת מסילות הברזל המצריות.
במצרים ייסד את אגודת 'צדקה ומרפא', שמטרתה סיוע לחולים עניים. הוא תרגם לשפה הערבית ספרי יסוד מהמסורת היהודית, ביניהם הסידור, ההגדה של פסח, תרי"ג מצוות, ופרקי אבות. הוא הוציא לאור מילונים וספרי לימוד. הוא תרגם יצירות מופת כלליות, וכתב בעיתון היהודי א-שמס, בשפה הערבית.
בשנת תרצ"ז (1937) הוציא לאור את ספרו 'יסודות הדת', ואת ספר התרגום עם פירושים, 'זיכרונות לבית דוד', יחד עם ניסים מלול. וכן חיבר שירים ופיוטים.
חכם ד"ר הלל פרחי נפטר ביום כ"ב בתמוז ה'ת"ש (1940) בקהיר.