חכם ידידיה טולידאנו נולד לאמו ואביו חכם אברהם טולידאנו בשנת תרמ"ג (1883) במכנס במרוקו.
עמד בראש ישיבה בעיר מכנס, והעמיד תלמידים רבים, בתוכם החכם יצחק חזן. תפילתו עשה קבע בבית הכנסת אלעטאר. בשנת תרפ"ה (1925), היה שותף בהקמת אגודת ביקור חולים שהגישה עזרה רפואית חינם לעניי העיר. לחכם ידידיה טולידאנו נולדו בנים ובנות, בתוכם ד"ר חיים טולידאנו, שהשתדל בהוצאת חיבורו של אביו חכם ידידיה טולידאנו, החיבור 'יד ידידיה'.
חכם ידידיה טולידאנו נפטר ביום ו' אדר תש"ג (1943) ונטמן בעירו מכנס.