חכם רחמים בן עמארה נולד לאמו רבקה ולאביו חכם ברוך בשנת תרע"ד (1904) במכנאס שבמרוקו.
אמו היא בת למשפחת הרבנים בירדוגו, ואביו תלמיד חכם, שלימד תורה בעיר.
משנת תשי"ז (1954) היה חבר בית הדין בקזבלנקה, ושימש כסגנו של חכם שלום משאש.
חכם רחמים בן עמארה היה פעיל בעלייתם החשאית של יהודי מרוקו ארצה, וחילק עלונים על המתרחש בארץ בבתי כנסת. בשנת תשכ"ה (1965) זכה ועלה לארץ, והתגורר בשכונת בית הכרם, בירושלים.
בשנת תשכ"ז (1967) החל לשמש רב השכונות עיר גנים וקריית מנחם, עד פרישתו, בשנת תשמ"ט (1989).
חכם רחמים בן עמארה היה דרשן, מסדר קידושין וענה על שאלות בהלכה. הוא הקים מוסד עזרה לנזקקים בשם 'חסד ורחמים', מוסדות לימוד תורה לבעלי בתים בשם 'חדש ימינו', וחברת לימוד תהלים בשם 'תהלה לדוד'. לאחר פרישתו מן הרבנות כתב את חיבוריו.
חכם בן עמארה נפטר ביום א' תשרי תשס"ב (2001) ונקבר בירושלים.
חיבוריו הם: 'לעת מצוא' - דרושים ומנהגים לשעת פטירת המת, 'תשועת צדיקים' - על צדיקים והילולת הרשב"י, וספר הדרכה למשפחה. הספרים התפרסמו בעברית ובצרפתית.