חכם יעקב חדאד נולד לאימו מרת מזלה ולאביו חכם רחמים חדאד בשנת תרל"ב (1872) בג'רבה.
ראשית תורתו למד מפי חכם יוסף ברבי בדייני העיר ג'רבה. אחר העמיק בחוכמת הקבלה, והיה מתכתב עם חכם עובדיה הדאיה, מישיבת המקובלים 'עוז והדר' בישיבת 'פורת יוסף' בירושלים. אביו, חכם רחמים חדאד, אסף פרוטה לפרוטה בקופסא מיוחדת בכדי לזכות לעלות לארץ ישראל, ולימים זכה ועלה.
נשא לאישה את מרת שרה, שנפטרה בשנת תר"פ (1920), ובזיווג שני נשא לאישה את מרת יסמינה.
הקים בית דפוס בשותפות עם חכם דוד עידאן בחומת א-סוק, המרכז המסחרי של העיר ג'רבה, בו נדפסו רבים מספריהם של חכמי הדור מצפון אפריקה. לימים עבר בית הדפוס לבעלותו הבלעדית.
חכם יעקב חדאד עסק בתורה יומם וליל, ונמנע מעיסוק במסחר. היה ענוותן, והעלים שמו מן הספרים שחיבר. זכה לבנים יראי שמים, והניח אחריו את בנו חכם ישועה חדאד, שימלא מקומו בחוכמת התורה והקבלה.
חכם יעקב חדאד נפטר ביום ט"ז סיון תש"ט (1949).
חיבוריו שנדפסו הם 'גואלי חי' - פירושים על דרך הקבלה להגדה של פסח יצא לאור בשנת תרפ"ה (1925), 'ויצב יעקב' ו'אחיעזר' יצא לאור בשנת תרצ"ו (1936), וספר 'מהללאל' - על תהילים יצא לאור בשנת תשי"א (1951). חיבוריו 'ויחי יעקב' - על התנ"ך, 'וישכם יעקב' – על התפילה, וספר 'חלוקא דרבנן ולבושים והדרנים על המסכתות', וספר 'אחי טוב' - נותרו בכתב יד.