חכם יצחק אלימלך נולד לאימו אסתר ולאביו חכם רפאל מאיר אלימלך בעיר ירושלים.
גדל בתורה וביראה בעיר ירושלים, ולמד מפי הראשון לציון החכם המקובל שלמה משה סוזין. הקדיש עצמו ללימוד התורה, בעוני ובדחק. היה מזכה הרבים בדרשותיו, ולימד תורה בירושלים ובאיזמיר.
בשנת תקצ"א (1831) יצא מירושלים אל העיר קושטא, ובדרכו עבר בארם צבא, שם שהה במשך ארבעה חודשים, ודרש בתורה. בשנת תקצ"ב (1832), הוציא לאור את ספרו 'הי"א שיחתי' - דרושים, בעיר קושטא.
יום פטירתו אינו ידוע לנו, אנו מציינים אותו ביום א' ניסן, יום בו חכם יצחק ענתבי, ראש חכמי ארם צובא, חתם על הקדמתו לספרו של חכם יצחק אלימלך 'הי"א שיחתי'.