חכם סאסי יהונתן הכהן מעתוק נולד לאביו ולאמו בשנת תקצ"א (1831) בג'רבה.
הוריו העניים הקדישו בנם, במסירות נפש, ללימוד התורה. ראשית תורתו למד מפי חכם יצחק צדיקא וחכם מנחם מאזוז. גדל בתורה וביראה, הוסמך לרבנות, ושימש דיין בג'רבה. היה עמל ושוקד על התורה בחשק גדול, הרביץ תורה ברבים, והעמיד תלמידים הרבה. נתעלה, והיה לאחד משלושת הדיינים המפורסמים בג'רבה. בערוב ימיו שימש ראש אבות בתי הדין בג'רבה. בעת זקנותו, מינה את, אחיינו, חכם ציון כהן יהונתן, מחבר 'שערי ציון' כמחליפו בבית הדין. הספיק לסדר לדפוס את ספריו 'ברכת ה'' ו'זכות יצחק' - תלמוד, ו'זרע דוד' דרושים ופסקים, ביום י"ד חשוון תרס"ה (1905), אך לא זכה לראותם יוצאים לאור.
חכם סאסי יהונתן הכהן מעתוק נפטר, ארבעה ימים לאחר מכן, ביום י"ט בחשון שנת תרס"ה (1905). ספריו יצאו לאור בכמה מהדורות בירושלים ובג'רבה.