חכם יצחק מאגריסו נולד לאימו ולאביו חכם משה בקושטא שבתורכיה.
גדל בתורה וביראה על ברכי חכמי עירו קושטא, נסמך כחכם השלם, ושימש דיין בעירו קושטא.
בשנת תצ"ב (1732), לאחר פטירתו של חכם יעקב כולי, המשיך את מפעלו המונומנטאלי של חכם יעקב כולי 'מעם לועז'. חכם יעקב כולי הספיק לחבר את כרך ספר בראשית, וחלק מספר שמות עד פרשת תרומה.
בשנת תק"ז (1746) חכם יצחק מאגריסו הוציא לאור את כרך שמות של 'מעם לועז', בתמיכתו של הגביר החכם יהודה מזרחי. בשנת תקי"ג (1753) הוציא לאור את כרך ויקרא של 'מעם לועז'. בתמיכת השר ישעיה אג'ימאן, שהיה בנקאי של ראש צבא היניצ'רים העות'מאני. בשנת תקכ"ד (1764) הוציא לאור את כרך במדבר של 'מעם לועז'. בהקדמה לכרך זה, הוא מבקש מהקוראים להמשיך להזמין ולשלם עבור הדפסת גיליונות 'מעם לועז', וכך לממן את המשך הדפסת גיליונות הספר. חכם יצחק מאגריסו לא הספיק לחבר את כרך דברים של 'מעם לועז', ואת הכרך חיבר לאחר פטירת חכם יצחק מאגריסו, חכם יצחק ארגואיטי.
יום פטירתו של חכם יצחק מאגריסו אינו ידוע לנו. אנו מציינים אותו ביום כ"ד בטבת, חודש בו הודפסה בקושטא המהדורה הראשונה של פירושו לספר שמות