חכם יעקב כאלפון נולד לאמו ולאביו יוסף, בשנת תקס"ח (1808) בעיר טיטואן שבמרוקו.
מילדותו עמל בתורה מתוך מחסור. לימים נשא לאישה את שימחה ביתו של חכם יצחק נהון ולהם נולדו ילדים.
חכם יעקב כאלפון התנהג בחסידות, קדושה ופרישות, ועסק רבות הן בתורת הנסתר והן בנגלה.
חכם יעקב כאלפון כיהן כאב בית הדין בטיטואן.
חכם יעקב כאלפון נפטר ביום י"ט אב תרט"ו (1855).
חכם יעקב כאלפון כתב ספרים רבים וביניהם: 'דורש טוב'- דרושים, 'ויעמידה ליעקב'- חידושים על התורה, 'משפטים צדיקים, ב' חלקים'- שו"ת, 'רנו ליעקב שימחה'- חידושים על הפרשיות, 'נגד מלכים' 'חסד ה' ועוד.