1925-1835הוא למד תורה אצל החכם השלם חכם כליפה עידאן, ובבגרותו, שלח ידו במסחר, וה' הצליח בידו. חכם שלום דניאל יהודה כהן היה לאחד מגדולי עירו, היה גומל חסדים לרבים ומחזיק ידי לומדי התורה. בכללם קיבל על עצמו בקביעות הוצאותיהם של שניים מגדולי ישראל - חכם דוד הכהן וחכם יעקב הכהן. לימים, התהפך עליו הגלגל. חכם שלום דניאל יהודה כהן עזב את מסחרו, ועסק בתורה בעוני.
בשנת תרנ"ב (1891) חכם שלום דניאל יהודה כהן עבר לעיר זרזיס, שבתוניסיה, שם שימש כרב העיר מורה צדק ומרביץ תורה, והיה מכובד גם אצל תושבי תוניסיה הערביים, שהיו מגיעים לקבל ברכות.
בשנת תרפ"ד (1921) עלה חכם שלום דניאל יהודה כהן לארץ ישראל, וגר בעיר טבריה.
חכם שלום דניאל יהודה כהן נלקח לבית עולמו בחול המועד סוכות, ביום י"ח תשרי שנת תרפ"ו (1926). לאחר החג הגיעה השמועה על פטירתו לאי ג'רבה, וגם שם הספידוהו בקהל רב.
חכם שלום דניאל יהודה כהן חיבר את הספרים הבאים: 'נהר שלום' - על התורה, 'דברי שאול' - על התורה, שחיבר יחד עם סבו, 'חפץ יקר' - על המצוות, 'חיים ושלום' - על המידות, 'שערי שלום' - על החושים.
