חכם שמואל מרציאנו נולד לאמו אסתר לבית ענקונינא ולאביו חכם משה בדובדו שבמזרח מרוקו.
ראשית תורתו מפי החכם דוד מרציאנו, ובהמשך למד מפי החכם דוד הכהן סקלי, ובבית מדרשם של חכם אברהם הכהן וחכם יוסף הכהן. אחיו עסקו במסחר, ותמכו בו כדי שיוכל להקדיש עצמו ללמוד תורה.
בשנת תרס"א (1901) חכם שמואל מרציאנו נשא לאשה את אסתר, בתו של חכם יוסף הכהן, ראש בית המדרש, ונולדו להם שבעה ילדים: אברהם חיים סעדיה, משה, סוזאן , סעודה ושימי.
בין השנים תר"פ (1920) לשנת תשט"ז (1956) חכם שמואל מרציאנו שימש כרב בכמה ערים במרוקו: תאוורית, אוטאט, מקנס, מאזאגאן וקזבלנקה.
בשנת תשט"ז (1956) נפטרה אשתו, אסתר. אחרי מותה עלה לארץ ישראל והתיישב בעיר לוד.
חכם שמואל מרציאנו נפטר ביום כ"ו ניסן תשכ"ב (1962) ונקבר בלוד.
ספרו 'ויען שמואל', הכולל תשובות הלכתיות, חידושים על התנ"ך וליקוטי מנהגים, יצא לאור בירושלים.