חכם יוסף די אבילה נולד לאמו ולאביו חכם יצחק די אבילה בעיר סאלי במרוקו.
ראשית תורתו למד מפי אביו החכם יצחק די אבילה בעיר סאלי. גדל בתורה וביראה ולמד במכנאס, בישיבת החכם משה בירדוגו, רב העיר מכנאס, ומחבר הספר 'ראש משביר'. דודו, הוא חכם שמואל די אבילה, דיין בעיר מכנאס, ומחבר הספר 'מעיל שמואל'. בן דודו, הוא החכם אליעזר די אבילה, רב העיר רבאט, מחבר הספר 'באר מים חיים'.
בשנת תע"ז (1717) החל לכתוב ספר חידושים אך הותירו בכתב יד, ולא זכה להוציאו לאור בחייו.
אין אנו יודעים מועד פטירתו, אנו מציינים אותו ביום ט"ו באב, יום בו החל לכתוב את ספר חידושיו. כתב ידו היה מוטל בקרן זווית במשך מאות בשנים, ובחסדי ה', כתב היד נגאל בידי החכם יצחק גרשון, מחכמי טיטואן, והוציאו לאור בשם 'ויבא יוסף', בירושלים בשנת תשנ"ב (1992).