מקצת שבחו

חכם רפאל בנציון הכהן נולד לאביו חכם שלום ולאימו זוהאר בג'רבה.
ראשית תורתו למד מפי אביו, חכם שלום הכהן, שהיה סופר בית הדין של ג'רבה אצל חכם כלפון משה הכהן. למרות הדוחק הגדול בו חיו, במצוות אביו לא פסק מלימודו, גדל בתורה וביראה ולמד מפי חכם חיים חורי, חכם מאיר ורג'אני הכהן, ומפי סבו, אבי אימו, חכם סאסי הכהן.
זכה ועלה לארץ ישראל עם הוריו, שהתיישבו בעיר נתיבות. לאחר תום שירותו הצבאי, החל לעבוד בחקלאות ובמפעל טקסטיל, אבל המשיך לשקוד על לימודו, והיה רושם את חידושיו בהפסקות ולאחר שעות העבודה. המשיך להשתתף בשיעורי הלכות, והיה שומע מדי שבת את דרשתו של חכם רפאל כדיר צבאן.
זכה במצוות כיבוד הורים, שגרו בביתו עד יום פטירתם. אביו חכם שלום הכהן נפטר בשנת תשכ"ט (1969). חכם רפאל בנציון הכהן ליקט ואסף את מאמרי אביו, והוציאם לאור בשנת תשל"א (1971), בירושלים, בספר: 'דרכי שלום'.
היה מוכר לתושבי נתיבות, קיבל כל אחד במאור פנים ועזר בתיקון חפצים שהתקלקלו.
חכם רפאל בנציון הכהן התכוון להוציא לאור את חידושיו, והתחיל להקלידם בעצמו במכונת כתיבה, אך בשל התדרדרות במצבו הבריאותי, בהיותו סובל קשות ממחלה נוראה וממושכת, מסר את כתביו לבנו חכם רחמים, ולחכם אשר חדאד, שערכו את הכתבים. בשנת תשנ"ה (1995) יצא לאור על ידם ספרו 'תרחם ציון' - חידושים.
חכם רפאל בנציון הכהן נפטר, מדוכא בייסורים, ביום ז' אדר ב' תשנ"ז (1997).